Вначале удовлетворяются конкурентные заявки по цене, равной или превышающей цену отсечения, а потом уже в пределах заранее установленного лимита исполняются неконкурентные заявки. Для участия во вторичных торгах по покупке-продаже уже находящихся в обращении ценных бумаг в дни торговых сессий банк-дилер выставляет свои заявки в торговую систему с указанием их направленности (покупка или продажа). Каждому участнику торгов до их начала устанавливаются денежные позиции и позиции по ценным бумагам. Денежные позиции определяются на основе данных о сумме денежных средств, зарезервированных участником на соответствующем счете в расчетной системе биржи. Позиции по ценным бумагам устанавливаются исходя из количества ценных бумаг, задепонированных участником на соответствующих счетах ДЕПО в уполномоченном депозитарии. В дальнейшем в ходе торгов это позволяет обеспечить контроль достаточности обеспечения для соблюдения основного принципа биржевых торгов — «поставка против платежа», а следовательно, уберечь банков-участников фондового рынка и их клиентов от риска потери денежных средств и ценных бумаг.

Заключение сделки в системе вторичных торгов происходит автоматически при совпадении следующих условий двух противоположной направленности заявок: наименование ценных бумаг, количество ценных бумаг, цена за одну ценную бумагу, ставка фиксированного возмещения, код расчетов по сделке (ТО, ВО — BЗO). При другом варианте исполнение заявки осуществляется в зависимости от ее вида: лимитированная она либо рыночная. Лимитированная заявка указывает на согласие купить определенное количество ценных бумаг (или лотов) по цене не выше указанной в ней или продать по цене не ниже указанной в такой заявке минимальной цены продажи. Рыночная заявка выражает согласие купить или продать определенное количество ценных бумаг (или лотов) по лучшим ценам или по курсу электронного фиксинга.

Документом, подтверждающим подачу банком — членом фондовой секции биржи заявки на заключение сделки, является выписка из протокола торгов, в которой отражаются все заявки, поданные банком — членом секции в течение торгового дня. Документом, подтверждающим заключение банком — членом фондовой секции биржи сделки, является натиска из реестра, в которой отражаются все сделки, заключенные членом секции в течение торгового дня.